反滲透或納濾系統回收率是指反滲透設備在實際使用時總的回收率，回收率受給水水質、膜元件的數量及排列方式等多種因素的影響，小型反滲透設備由于膜元件的數量少、給水流程短，因而系統回收率普遍偏低。而工業用大型反滲透設備由于膜元件的數量多、給水流程長，所以實際系統回收率一般均在75%以上，有時甚至可以達到90%。
　　在某些情況下對于小型反滲透設備也要求較高的系統回收率，以免造成水資源的浪費，此時在設計反滲透設備時就需要釆取一些不同的對策。最常見的對策是釆用濃水部分循環，即反滲透裝置的濃水只排放一部分，其余部分循環進入給水泵入口，此時既可保證膜元件表面維持一定的橫向流速，又可以達到用戶所需要的系統回收率。

　　反滲透純水設備以及超純水設備納濾系統的回收率和原水中溶解物質的濃縮倍率有直接關系，回收率50%的系統，濃縮倍數是2倍；回收率75%時，濃縮倍數是4倍；回收率80%時，濃縮率則為5倍；回收率達到90%時，相當于濃縮10倍。
　　膜系統內由于濃差極化現象的存在，膜表面的料液含鹽量會變得更高。因此，原水由于被濃縮，膜表面的污染會比想象中發生的更快，一般回收率在苦咸水脫鹽處理中設置在50%-80%左右。
　　系統的運行條件、原水的特性狀態等因素會影響回收率的確定，一旦選擇過高的回收率，就會面臨結構的形成和急速污染的風險。
　　由此，按照實際情況適當的設定回收率就顯得尤為重要。基于原水的水質分析數據結合其四季變動，考慮前處理和產水的回收率、運行溫度等相關的反滲透系統設計方式，設定運行條件。